Głęboka żyła grzbietowa penisa odprowadza zubożoną w tlen krew z żołędzi, czyli zewnętrznej głowy narządu płciowego.
Ta żyła biegnie wzdłuż trzonu i ostatecznie wpływa do splotu żylnego prostaty w pobliżu gruczołu prostaty mężczyzny. Stamtąd odtleniona krew musi przepływać przez układ żylny, aż dotrze do środka układu krążenia w celu uzupełnienia tlenu w płucach i recyrkulacji przez lewą stronę serca.
Żyła to nie to samo, co tętnica o podobnej nazwie, która przesyła natlenioną krew do żołędzi. Jednak głęboka żyła grzbietowa prącia przebiega podobnie jak jej tętniczy odpowiednik.
Biegnie również bezpośrednio pod powierzchowną żyłą grzbietową prącia. Jednak warstwa głębokiej powięzi (tkanki łącznej) oddziela dwa żylne naczynia krwionośne.
Ponieważ penis jest unikalny dla męskiej anatomii, obie żyły są również unikalne dla męskiego ciała. Dla celów porównawczych najbliższym związkiem w ciele kobiety byłyby żyły obsługujące łechtaczkę.
